Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECI1P42126 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECI1P42126 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECI1P42126 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECI1P42126 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECI1P42126 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECI1P42126 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ECI1P42126 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ECI1P42126 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ECI1P42126 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECI1P42126 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ECI1P42126 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECI1P42126 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECI1P42126 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ECI1P42126 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECI1P42126 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECI1P42126 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECI1P42126 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ECI1P42126 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECI1P42126 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECI1P42126 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECI1P42126 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECI1P42126 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ECI1P42126 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECI1P42126 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECI1P42126 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECI1P42126 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECI1P42126 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECI1P42126 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECI1P42126 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECI1P42126 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECI1P42126 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECI1P42126 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ECI1P42126 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ECI1P42126 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ECI1P42126 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECI1P42126 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECI1P42126 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECI1P42126 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECI1P42126 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECI1P42126 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECI1P42126 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECI1P42126 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ECI1P42126 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECI1P42126 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECI1P42126 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECI1P42126 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECI1P42126 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ECI1P42126 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms