Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PNPLA4P41247 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PNPLA4P41247 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA4P41247 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA4P41247 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA4P41247 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA4P41247 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA4P41247 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA4P41247 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA4P41247 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA4P41247 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA4P41247 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms