Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 NAT2YGR147C 867 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 ECM1YAL059W 639 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 GRE1YPL223C 507 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 TDA6YPR157W 1404 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 SIF2YBR103W 1608 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 ARG82YDR173C 1068 nt4.92□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 HSP31YDR533C 714 nt4.92□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 FBP1YLR377C 1047 nt4.92□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 ADD37YMR184W 597 nt4.92□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 SAP30YMR263W 606 nt4.92□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 SAP4YGL229C 2457 nt4.92□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 SUM1YDR310C 3189 nt4.92□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 SAF1YBR280C 1914 nt4.91□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 GPR1YDL035C 2886 nt4.91□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 MNN11YJL183W 1269 nt4.91□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 TVP38YKR088C 1014 nt4.91□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 CPR6YLR216C 1116 nt4.91□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 HLJ1YMR161W 675 nt4.91□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 KRS1YDR037W 1776 nt4.91□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 TSL1YML100W 3297 nt4.91□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YMR111CYMR111C 1389 nt4.91□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 EAR1YMR171C 1653 nt4.9□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 CBF5YLR175W 1452 nt4.9□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YGR122WYGR122W 1209 nt4.9□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 NMA1YLR328W 1206 nt4.9□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.9□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 IMA3YIL172C 1770 nt4.9□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 IMA4YJL221C 1770 nt4.9□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 PRD1YCL057W 2139 nt4.9□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 MSC2YDR205W 2175 nt4.89□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 NUP2YLR335W 2163 nt4.89□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 CAB3YKL088W 1716 nt4.89□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 YGR125WYGR125W 3111 nt4.89□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 TYW3YGL050W 822 nt4.89□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 YNL194CYNL194C 906 nt4.89□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 UBA3YPR066W 900 nt4.89□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 CTT1YGR088W 1689 nt4.89□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 SIS2YKR072C 1689 nt4.89□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 CPS1YJL172W 1731 nt4.89□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 SWC3YAL011W 1878 nt4.88□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 COA3YJL062W-A 258 nt4.88□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 SCP1YOR367W 603 nt4.88□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 PSY4YBL046W 1326 nt4.88□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 LPL1YOR059C 1353 nt4.88□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 PCL8YPL219W 1479 nt4.88□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 FAA3YIL009W 2085 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 ALG6YOR002W 1635 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 YDL012CYDL012C 324 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 ARF2YDL137W 546 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 GLE2YER107C 1098 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 SPR6YER115C 576 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 SMA1YPL027W 738 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 UMP1YBR173C 447 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 EGT2YNL327W 3126 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 MET4YNL103W 2019 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 SEG2YKL105C 3399 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 NMD3YHR170W 1557 nt4.87□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 STE12YHR084W 2067 nt4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 YJL215CYJL215C 360 nt4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 YNL134CYNL134C 1131 nt4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 CDC21YOR074C 915 nt4.86□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 SFI1YLL003W 2841 nt4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 ZRT1YGL255W 1131 nt4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 SPS18YNL204C 903 nt4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 HAL1YPR005C 885 nt4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 IMD2YHR216W 1572 nt4.85□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 HSP82YPL240C 2130 nt4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 YCR006CYCR006C 474 nt4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 PER1YCR044C 1074 nt4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 CPR4YCR069W 957 nt4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 LSO1YJR005C-A 282 nt4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 SPO19YPL130W 672 nt4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 PEP4YPL154C 1218 nt4.84□□□□□ -1.63
SHQ1P40486 MAG2YLR427W 2013 nt4.84□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 PTR2YKR093W 1806 nt4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 OLE1YGL055W 1533 nt4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 UPS3YDR185C 540 nt4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 MDR1YGR100W 2853 nt4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 FPK1YNR047W 2682 nt4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 FZO1YBR179C 2568 nt4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 GIP2YER054C 1647 nt4.83□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 STP4YDL048C 1473 nt4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 ISR1YPR106W 1332 nt4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 LUC7YDL087C 786 nt4.82□□□□□ -1.64
SHQ1P40486 snR7-SsnR7-S 179 nt4.82□□□□□ -1.64
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