Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PBX2P40425 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX2P40425 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX2P40425 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PBX2P40425 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX2P40425 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX2P40425 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX2P40425 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX2P40425 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX2P40425 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX2P40425 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX2P40425 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX2P40425 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PBX2P40425 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX2P40425 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX2P40425 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX2P40425 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX2P40425 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX2P40425 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX2P40425 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX2P40425 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX2P40425 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PBX2P40425 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX2P40425 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX2P40425 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX2P40425 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX2P40425 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX2P40425 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX2P40425 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX2P40425 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX2P40425 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PBX2P40425 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX2P40425 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX2P40425 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX2P40425 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX2P40425 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX2P40425 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX2P40425 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX2P40425 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX2P40425 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX2P40425 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PBX2P40425 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX2P40425 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX2P40425 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX2P40425 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX2P40425 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX2P40425 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX2P40425 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX2P40425 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX2P40425 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX2P40425 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PBX2P40425 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PBX2P40425 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX2P40425 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX2P40425 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX2P40425 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX2P40425 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX2P40425 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX2P40425 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX2P40425 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PBX2P40425 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX2P40425 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX2P40425 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX2P40425 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX2P40425 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX2P40425 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX2P40425 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX2P40425 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX2P40425 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX2P40425 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX2P40425 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX2P40425 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX2P40425 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX2P40425 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX2P40425 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX2P40425 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX2P40425 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX2P40425 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX2P40425 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX2P40425 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX2P40425 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX2P40425 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX2P40425 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX2P40425 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX2P40425 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX2P40425 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms