Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CEACAM3P40198 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CEACAM3P40198 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CEACAM3P40198 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms