Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCAP37840 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCAP37840 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCAP37840 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCAP37840 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCAP37840 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCAP37840 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCAP37840 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCAP37840 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNCAP37840 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNCAP37840 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNCAP37840 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCAP37840 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCAP37840 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCAP37840 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCAP37840 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCAP37840 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCAP37840 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCAP37840 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCAP37840 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCAP37840 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCAP37840 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNCAP37840 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNCAP37840 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNCAP37840 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNCAP37840 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNCAP37840 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCAP37840 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCAP37840 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCAP37840 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCAP37840 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCAP37840 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCAP37840 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCAP37840 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCAP37840 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCAP37840 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCAP37840 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNCAP37840 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCAP37840 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCAP37840 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCAP37840 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCAP37840 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCAP37840 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCAP37840 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCAP37840 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCAP37840 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCAP37840 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCAP37840 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCAP37840 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNCAP37840 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCAP37840 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCAP37840 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCAP37840 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCAP37840 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCAP37840 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCAP37840 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCAP37840 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCAP37840 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCAP37840 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCAP37840 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCAP37840 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNCAP37840 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNCAP37840 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms