Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPA3P35244 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RPA3P35244 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RPA3P35244 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPA3P35244 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPA3P35244 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPA3P35244 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPA3P35244 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA3P35244 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA3P35244 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA3P35244 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA3P35244 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA3P35244 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA3P35244 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA3P35244 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA3P35244 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPA3P35244 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPA3P35244 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA3P35244 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA3P35244 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA3P35244 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA3P35244 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA3P35244 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA3P35244 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA3P35244 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA3P35244 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA3P35244 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA3P35244 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA3P35244 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPA3P35244 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA3P35244 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA3P35244 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA3P35244 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA3P35244 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA3P35244 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA3P35244 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPA3P35244 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPA3P35244 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPA3P35244 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPA3P35244 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPA3P35244 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPA3P35244 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPA3P35244 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPA3P35244 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPA3P35244 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPA3P35244 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPA3P35244 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPA3P35244 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA3P35244 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA3P35244 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA3P35244 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA3P35244 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA3P35244 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA3P35244 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA3P35244 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA3P35244 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA3P35244 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPA3P35244 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA3P35244 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA3P35244 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPA3P35244 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms