Protein–RNA interactions for Protein: P33121

ACSL1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL1P33121 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL1P33121 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL1P33121 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL1P33121 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms