Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSG3P32926 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG3P32926 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG3P32926 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG3P32926 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG3P32926 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG3P32926 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG3P32926 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG3P32926 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG3P32926 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG3P32926 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG3P32926 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG3P32926 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG3P32926 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG3P32926 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG3P32926 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG3P32926 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG3P32926 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG3P32926 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG3P32926 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG3P32926 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG3P32926 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG3P32926 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG3P32926 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG3P32926 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG3P32926 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG3P32926 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG3P32926 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DSG3P32926 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DSG3P32926 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DSG3P32926 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DSG3P32926 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
DSG3P32926 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DSG3P32926 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DSG3P32926 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG3P32926 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG3P32926 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG3P32926 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG3P32926 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG3P32926 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG3P32926 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG3P32926 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DSG3P32926 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DSG3P32926 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DSG3P32926 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DSG3P32926 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DSG3P32926 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DSG3P32926 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DSG3P32926 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DSG3P32926 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DSG3P32926 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DSG3P32926 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG3P32926 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG3P32926 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG3P32926 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG3P32926 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG3P32926 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG3P32926 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG3P32926 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG3P32926 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG3P32926 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG3P32926 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG3P32926 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG3P32926 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG3P32926 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG3P32926 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG3P32926 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG3P32926 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG3P32926 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG3P32926 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG3P32926 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG3P32926 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG3P32926 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG3P32926 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG3P32926 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG3P32926 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG3P32926 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG3P32926 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG3P32926 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG3P32926 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG3P32926 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG3P32926 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG3P32926 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG3P32926 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG3P32926 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG3P32926 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG3P32926 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG3P32926 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG3P32926 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG3P32926 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSG3P32926 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSG3P32926 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSG3P32926 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSG3P32926 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DSG3P32926 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSG3P32926 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSG3P32926 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSG3P32926 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSG3P32926 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSG3P32926 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.9 ms