Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	SSZ1	YHR064C	1617 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	DAL81	YIR023W	2913 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	PXA1	YPL147W	2613 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	AMD1	YML035C	2433 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	MAK31	YCR020C-A	267 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	OPI7	YDR360W	435 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YGR122W	YGR122W	1209 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	SUP19	tS(UGA)E	82 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	SUP17	tS(UGA)I	82 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	SUP16	tS(UGA)P	82 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	RPF2	YKR081C	1035 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	CDC73	YLR418C	1182 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YMR122C	YMR122C	375 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	SSU72	YNL222W	621 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YNG1	YOR064C	660 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	BBP1	YPL255W	1158 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	KRS1	YDR037W	1776 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	ALG9	YNL219C	1668 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	BIT2	YBR270C	1638 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	PRP19	YLL036C	1512 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	MGR3	YMR115W	1506 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	ADE6	YGR061C	4077 nt		4.82	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	MDM10	YAL010C	1482 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	HMS1	YOR032C	1305 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	ASA1	YPR085C	1332 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	AIM6	YDL237W	1173 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	TFG2	YGR005C	1203 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YKR041W	YKR041W	753 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	TIS11	YLR136C	858 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	SLX1	YBR228W	915 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	SRB6	YBR253W	366 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	PDI1	YCL043C	1569 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	OSW2	YLR054C	2175 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	SLT2	YHR030C	1455 nt		4.81	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	SEC9	YGR009C	1956 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	APE3	YBR286W	1614 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	PRP9	YDL030W	1593 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YDR109C	YDR109C	2148 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	RPB7	YDR404C	516 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YER187W	YER187W	426 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	DDI2	YFL061W	678 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	MPS2	YGL075C	1164 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	VPS24	YKL041W	675 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	URA4	YLR420W	1095 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	DDI3	YNL335W	678 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YOL162W	YOL162W	648 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	BSD2	YBR290W	966 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	ADY3	YDL239C	2373 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	NGR1	YBR212W	2019 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	CDC1	YDR182W	1476 nt		4.8	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YTA6	YPL074W	2265 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YML082W	YML082W	1950 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	RPC53	YDL150W	1269 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	KEG1	YFR042W	603 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	RPC17	YJL011C	486 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	HYM1	YKL189W	1200 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	TEX1	YNL253W	1269 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	CAF40	YNL288W	1122 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	NAT3	YPR131C	588 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	MRPL37	YBR268W	318 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	GRX1	YCL035C	333 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	HAP1	YLR256W	4509 nt		4.79	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YHR177W	YHR177W	1362 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	HES1	YOR237W	1305 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	SYG1	YIL047C	2709 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	SIT4	YDL047W	936 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	SHR3	YDL212W	633 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YER085C	YER085C	522 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	SDT1	YGL224C	843 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	NQM1	YGR043C	1002 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	PAN5	YHR063C	1140 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	AIM23	YJL131C	1071 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YCL041C	YCL041C	495 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	UTP18	YJL069C	1785 nt		4.78	□□□□□ -1.64
SIP1	P32578	YDR444W	YDR444W	2064 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	PCL8	YPL219W	1479 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	FPK1	YNR047W	2682 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	CDC4	YFL009W	2340 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	PEX19	YDL065C	1029 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	GLE2	YER107C	1098 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	YHR069C-A	YHR069C-A	363 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	ARG3	YJL088W	1017 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	TDH2	YJR009C	999 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	GMH1	YKR030W	822 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	RAT1	YOR048C	3021 nt		4.77	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	YDL158C	YDL158C	309 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	TMN2	YDR107C	2019 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	GLO2	YDR272W	825 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	RNH202	YDR279W	1053 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	YDR290W	YDR290W	330 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	PIB1	YDR313C	861 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	YER010C	YER010C	705 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	YER084W	YER084W	387 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	YFR035C	YFR035C	345 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	CAX4	YGR036C	720 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	YGR283C	YGR283C	1026 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	TTI2	YJR136C	1266 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	DRE2	YKR071C	1047 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	YLR118C	YLR118C	684 nt		4.76	□□□□□ -1.65
SIP1	P32578	ATG16	YMR159C	453 nt		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.4 ms