Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
OTX2P32243 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX2P32243 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX2P32243 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX2P32243 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX2P32243 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX2P32243 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
OTX2P32243 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OTX2P32243 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX2P32243 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX2P32243 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX2P32243 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX2P32243 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX2P32243 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX2P32243 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX2P32243 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OTX2P32243 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX2P32243 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX2P32243 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX2P32243 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX2P32243 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX2P32243 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX2P32243 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX2P32243 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OTX2P32243 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OTX2P32243 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX2P32243 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX2P32243 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX2P32243 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX2P32243 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX2P32243 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX2P32243 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX2P32243 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX2P32243 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX2P32243 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OTX2P32243 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTX2P32243 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTX2P32243 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OTX2P32243 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
OTX2P32243 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX2P32243 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX2P32243 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX2P32243 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX2P32243 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX2P32243 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX2P32243 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX2P32243 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OTX2P32243 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX2P32243 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX2P32243 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX2P32243 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX2P32243 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX2P32243 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX2P32243 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OTX2P32243 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX2P32243 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX2P32243 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX2P32243 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX2P32243 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX2P32243 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OTX2P32243 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms