Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PPIFP30405 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPIFP30405 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPIFP30405 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPIFP30405 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPIFP30405 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PPIFP30405 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPIFP30405 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPIFP30405 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PPIFP30405 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PPIFP30405 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPIFP30405 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PPIFP30405 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPIFP30405 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPIFP30405 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPIFP30405 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPIFP30405 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPIFP30405 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPIFP30405 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPIFP30405 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PPIFP30405 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PPIFP30405 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PPIFP30405 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPIFP30405 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPIFP30405 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPIFP30405 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPIFP30405 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPIFP30405 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPIFP30405 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPIFP30405 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPIFP30405 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPIFP30405 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPIFP30405 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPIFP30405 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPIFP30405 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPIFP30405 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPIFP30405 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPIFP30405 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPIFP30405 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPIFP30405 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms