Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMOD1P29536 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD1P29536 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms