Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLD1P28340 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
POLD1P28340 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLD1P28340 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
POLD1P28340 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLD1P28340 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLD1P28340 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLD1P28340 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLD1P28340 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLD1P28340 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLD1P28340 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLD1P28340 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLD1P28340 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
POLD1P28340 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLD1P28340 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLD1P28340 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
POLD1P28340 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
POLD1P28340 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLD1P28340 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLD1P28340 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLD1P28340 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLD1P28340 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLD1P28340 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLD1P28340 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLD1P28340 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLD1P28340 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLD1P28340 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
POLD1P28340 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLD1P28340 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLD1P28340 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLD1P28340 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLD1P28340 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLD1P28340 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLD1P28340 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLD1P28340 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLD1P28340 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLD1P28340 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLD1P28340 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLD1P28340 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLD1P28340 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLD1P28340 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLD1P28340 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLD1P28340 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLD1P28340 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLD1P28340 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLD1P28340 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLD1P28340 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
POLD1P28340 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLD1P28340 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLD1P28340 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLD1P28340 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLD1P28340 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLD1P28340 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLD1P28340 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLD1P28340 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLD1P28340 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLD1P28340 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLD1P28340 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
POLD1P28340 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
POLD1P28340 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLD1P28340 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLD1P28340 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLD1P28340 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLD1P28340 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLD1P28340 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLD1P28340 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLD1P28340 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLD1P28340 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLD1P28340 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLD1P28340 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLD1P28340 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLD1P28340 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLD1P28340 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLD1P28340 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLD1P28340 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLD1P28340 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLD1P28340 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLD1P28340 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLD1P28340 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLD1P28340 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLD1P28340 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLD1P28340 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLD1P28340 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLD1P28340 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLD1P28340 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLD1P28340 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLD1P28340 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLD1P28340 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLD1P28340 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLD1P28340 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLD1P28340 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLD1P28340 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLD1P28340 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLD1P28340 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLD1P28340 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLD1P28340 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLD1P28340 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLD1P28340 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLD1P28340 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLD1P28340 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms