Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMOD1P28289 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMOD1P28289 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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