Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMB9P28065 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMB9P28065 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms