Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CNTFRP26992 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CNTFRP26992 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms