Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IL3RAP26951 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IL3RAP26951 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms