Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD27P26842 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD27P26842 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD27P26842 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD27P26842 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD27P26842 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD27P26842 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD27P26842 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD27P26842 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD27P26842 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD27P26842 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD27P26842 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD27P26842 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD27P26842 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD27P26842 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD27P26842 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD27P26842 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD27P26842 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD27P26842 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD27P26842 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD27P26842 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD27P26842 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD27P26842 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD27P26842 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD27P26842 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD27P26842 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD27P26842 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD27P26842 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD27P26842 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD27P26842 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD27P26842 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD27P26842 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD27P26842 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD27P26842 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD27P26842 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD27P26842 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD27P26842 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD27P26842 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD27P26842 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD27P26842 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD27P26842 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD27P26842 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD27P26842 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD27P26842 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD27P26842 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD27P26842 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD27P26842 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD27P26842 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms