Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP5F1P24539 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP5F1P24539 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms