Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRZ1P23471 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRZ1P23471 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRZ1P23471 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms