Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ITGA6P23229 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ITGA6P23229 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms