Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FGFR4P22455 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FGFR4P22455 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms