Protein–RNA interactions for Protein: P21580

TNFAIP3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP3P21580 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFAIP3P21580 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFAIP3P21580 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNFAIP3P21580 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNFAIP3P21580 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNFAIP3P21580 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms