Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTF3P20783 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTF3P20783 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTF3P20783 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTF3P20783 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NTF3P20783 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTF3P20783 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTF3P20783 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTF3P20783 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTF3P20783 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NTF3P20783 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTF3P20783 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTF3P20783 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTF3P20783 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTF3P20783 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTF3P20783 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTF3P20783 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTF3P20783 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTF3P20783 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTF3P20783 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NTF3P20783 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NTF3P20783 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTF3P20783 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTF3P20783 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTF3P20783 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTF3P20783 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTF3P20783 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NTF3P20783 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTF3P20783 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTF3P20783 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTF3P20783 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTF3P20783 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTF3P20783 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NTF3P20783 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NTF3P20783 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NTF3P20783 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms