Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TRHP20396 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRHP20396 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRHP20396 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRHP20396 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRHP20396 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRHP20396 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRHP20396 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRHP20396 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRHP20396 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRHP20396 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRHP20396 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRHP20396 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRHP20396 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRHP20396 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TRHP20396 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRHP20396 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TRHP20396 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRHP20396 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRHP20396 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TRHP20396 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRHP20396 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TRHP20396 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
TRHP20396 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
TRHP20396 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRHP20396 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRHP20396 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRHP20396 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRHP20396 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRHP20396 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRHP20396 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
TRHP20396 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRHP20396 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRHP20396 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRHP20396 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TRHP20396 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TRHP20396 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TRHP20396 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
TRHP20396 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRHP20396 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRHP20396 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRHP20396 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRHP20396 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRHP20396 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRHP20396 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRHP20396 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRHP20396 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRHP20396 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRHP20396 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRHP20396 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRHP20396 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRHP20396 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRHP20396 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRHP20396 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRHP20396 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
TRHP20396 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRHP20396 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRHP20396 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRHP20396 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRHP20396 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRHP20396 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
TRHP20396 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRHP20396 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRHP20396 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRHP20396 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRHP20396 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRHP20396 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRHP20396 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
TRHP20396 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRHP20396 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
TRHP20396 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRHP20396 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRHP20396 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRHP20396 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRHP20396 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRHP20396 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRHP20396 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRHP20396 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRHP20396 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRHP20396 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRHP20396 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRHP20396 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRHP20396 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRHP20396 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TRHP20396 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRHP20396 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TRHP20396 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRHP20396 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRHP20396 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRHP20396 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
TRHP20396 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRHP20396 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRHP20396 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
TRHP20396 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRHP20396 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRHP20396 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
TRHP20396 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRHP20396 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRHP20396 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRHP20396 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms