Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NR1D1P20393 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR1D1P20393 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms