Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB4AP20338 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB4AP20338 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB4AP20338 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms