Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNNI3P19429 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNNI3P19429 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms