Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDCP19113 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDCP19113 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDCP19113 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDCP19113 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDCP19113 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDCP19113 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDCP19113 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDCP19113 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDCP19113 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDCP19113 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDCP19113 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDCP19113 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDCP19113 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDCP19113 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDCP19113 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDCP19113 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDCP19113 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDCP19113 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDCP19113 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDCP19113 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDCP19113 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDCP19113 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDCP19113 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDCP19113 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDCP19113 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDCP19113 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDCP19113 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDCP19113 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDCP19113 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDCP19113 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDCP19113 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDCP19113 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDCP19113 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDCP19113 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDCP19113 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDCP19113 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDCP19113 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDCP19113 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDCP19113 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDCP19113 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDCP19113 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDCP19113 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDCP19113 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDCP19113 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDCP19113 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDCP19113 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDCP19113 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDCP19113 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDCP19113 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDCP19113 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HDCP19113 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDCP19113 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDCP19113 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDCP19113 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDCP19113 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDCP19113 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDCP19113 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HDCP19113 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDCP19113 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDCP19113 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms