Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VCLP18206 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCLP18206 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCLP18206 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCLP18206 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCLP18206 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCLP18206 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCLP18206 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCLP18206 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCLP18206 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCLP18206 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VCLP18206 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VCLP18206 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VCLP18206 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCLP18206 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCLP18206 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCLP18206 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VCLP18206 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCLP18206 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCLP18206 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCLP18206 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VCLP18206 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCLP18206 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCLP18206 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VCLP18206 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCLP18206 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VCLP18206 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCLP18206 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCLP18206 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCLP18206 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCLP18206 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCLP18206 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCLP18206 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCLP18206 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCLP18206 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCLP18206 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VCLP18206 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCLP18206 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCLP18206 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCLP18206 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VCLP18206 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCLP18206 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCLP18206 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCLP18206 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCLP18206 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCLP18206 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCLP18206 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCLP18206 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VCLP18206 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCLP18206 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
VCLP18206 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VCLP18206 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VCLP18206 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCLP18206 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCLP18206 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCLP18206 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCLP18206 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VCLP18206 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCLP18206 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCLP18206 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCLP18206 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCLP18206 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VCLP18206 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VCLP18206 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCLP18206 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCLP18206 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCLP18206 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCLP18206 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VCLP18206 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCLP18206 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCLP18206 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VCLP18206 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCLP18206 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCLP18206 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCLP18206 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCLP18206 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCLP18206 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VCLP18206 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VCLP18206 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VCLP18206 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VCLP18206 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VCLP18206 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCLP18206 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCLP18206 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCLP18206 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCLP18206 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VCLP18206 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VCLP18206 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms