Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPI1P17947 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPI1P17947 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SPI1P17947 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SPI1P17947 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPI1P17947 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPI1P17947 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPI1P17947 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPI1P17947 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SPI1P17947 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPI1P17947 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPI1P17947 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPI1P17947 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPI1P17947 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SPI1P17947 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPI1P17947 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPI1P17947 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPI1P17947 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPI1P17947 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPI1P17947 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPI1P17947 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPI1P17947 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPI1P17947 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPI1P17947 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SPI1P17947 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SPI1P17947 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPI1P17947 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPI1P17947 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPI1P17947 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPI1P17947 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPI1P17947 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SPI1P17947 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPI1P17947 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPI1P17947 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPI1P17947 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPI1P17947 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SPI1P17947 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SPI1P17947 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPI1P17947 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPI1P17947 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPI1P17947 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPI1P17947 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPI1P17947 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPI1P17947 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPI1P17947 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPI1P17947 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPI1P17947 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPI1P17947 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPI1P17947 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SPI1P17947 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SPI1P17947 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPI1P17947 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPI1P17947 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPI1P17947 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPI1P17947 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SPI1P17947 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SPI1P17947 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms