Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DESP17661 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DESP17661 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DESP17661 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DESP17661 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DESP17661 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DESP17661 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DESP17661 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DESP17661 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DESP17661 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DESP17661 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DESP17661 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DESP17661 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DESP17661 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DESP17661 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DESP17661 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DESP17661 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DESP17661 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DESP17661 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DESP17661 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DESP17661 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DESP17661 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DESP17661 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DESP17661 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DESP17661 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DESP17661 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DESP17661 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DESP17661 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DESP17661 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DESP17661 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DESP17661 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DESP17661 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DESP17661 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DESP17661 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DESP17661 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DESP17661 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DESP17661 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DESP17661 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DESP17661 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DESP17661 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DESP17661 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DESP17661 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DESP17661 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DESP17661 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DESP17661 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DESP17661 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DESP17661 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DESP17661 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DESP17661 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DESP17661 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DESP17661 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DESP17661 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DESP17661 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DESP17661 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DESP17661 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DESP17661 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DESP17661 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DESP17661 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DESP17661 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DESP17661 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DESP17661 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DESP17661 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DESP17661 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DESP17661 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DESP17661 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DESP17661 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DESP17661 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DESP17661 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DESP17661 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DESP17661 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms