Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CAPN2P17655 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CAPN2P17655 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CAPN2P17655 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms