Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOT1P17174 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOT1P17174 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOT1P17174 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOT1P17174 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOT1P17174 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOT1P17174 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOT1P17174 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOT1P17174 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOT1P17174 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOT1P17174 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOT1P17174 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOT1P17174 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOT1P17174 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOT1P17174 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOT1P17174 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOT1P17174 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOT1P17174 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOT1P17174 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOT1P17174 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOT1P17174 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOT1P17174 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOT1P17174 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOT1P17174 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOT1P17174 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GOT1P17174 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOT1P17174 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOT1P17174 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOT1P17174 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOT1P17174 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOT1P17174 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOT1P17174 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOT1P17174 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOT1P17174 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOT1P17174 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GOT1P17174 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOT1P17174 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOT1P17174 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GOT1P17174 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GOT1P17174 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOT1P17174 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOT1P17174 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOT1P17174 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOT1P17174 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOT1P17174 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOT1P17174 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOT1P17174 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOT1P17174 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GOT1P17174 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOT1P17174 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOT1P17174 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOT1P17174 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOT1P17174 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOT1P17174 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOT1P17174 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOT1P17174 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOT1P17174 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GOT1P17174 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GOT1P17174 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOT1P17174 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOT1P17174 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOT1P17174 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOT1P17174 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOT1P17174 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOT1P17174 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOT1P17174 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOT1P17174 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOT1P17174 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GOT1P17174 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOT1P17174 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GOT1P17174 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.1 ms