Protein–RNA interactions for Protein: P17081

RHOQ, Rho-related GTP-binding protein RhoQ, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOQP17081 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOQP17081 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOQP17081 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOQP17081 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOQP17081 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOQP17081 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOQP17081 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOQP17081 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOQP17081 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOQP17081 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOQP17081 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOQP17081 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOQP17081 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOQP17081 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOQP17081 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOQP17081 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOQP17081 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOQP17081 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOQP17081 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOQP17081 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOQP17081 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOQP17081 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOQP17081 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOQP17081 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOQP17081 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOQP17081 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOQP17081 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOQP17081 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOQP17081 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOQP17081 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOQP17081 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOQP17081 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOQP17081 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOQP17081 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOQP17081 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOQP17081 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOQP17081 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOQP17081 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOQP17081 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOQP17081 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOQP17081 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOQP17081 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOQP17081 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOQP17081 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOQP17081 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOQP17081 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOQP17081 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOQP17081 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOQP17081 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOQP17081 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOQP17081 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOQP17081 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOQP17081 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOQP17081 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOQP17081 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOQP17081 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOQP17081 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOQP17081 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms