Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF30P17039 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF30P17039 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF30P17039 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF30P17039 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF30P17039 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF30P17039 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF30P17039 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF30P17039 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF30P17039 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms