Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTLA4P16410 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms