Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NCK1P16333 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCK1P16333 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCK1P16333 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCK1P16333 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCK1P16333 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCK1P16333 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCK1P16333 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NCK1P16333 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NCK1P16333 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCK1P16333 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCK1P16333 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCK1P16333 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCK1P16333 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCK1P16333 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NCK1P16333 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCK1P16333 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCK1P16333 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCK1P16333 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NCK1P16333 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCK1P16333 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCK1P16333 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCK1P16333 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCK1P16333 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCK1P16333 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCK1P16333 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCK1P16333 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCK1P16333 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCK1P16333 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCK1P16333 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NCK1P16333 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCK1P16333 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCK1P16333 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCK1P16333 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCK1P16333 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCK1P16333 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCK1P16333 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCK1P16333 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NCK1P16333 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCK1P16333 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NCK1P16333 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCK1P16333 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCK1P16333 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCK1P16333 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCK1P16333 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCK1P16333 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCK1P16333 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCK1P16333 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCK1P16333 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCK1P16333 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCK1P16333 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCK1P16333 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCK1P16333 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCK1P16333 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCK1P16333 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCK1P16333 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCK1P16333 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCK1P16333 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCK1P16333 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCK1P16333 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCK1P16333 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCK1P16333 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCK1P16333 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCK1P16333 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCK1P16333 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCK1P16333 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCK1P16333 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NCK1P16333 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCK1P16333 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCK1P16333 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCK1P16333 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NCK1P16333 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCK1P16333 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms