Protein–RNA interactions for Protein: P16035

TIMP2, Metalloproteinase inhibitor 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP2P16035 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TIMP2P16035 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TIMP2P16035 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP2P16035 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP2P16035 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP2P16035 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP2P16035 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP2P16035 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMP2P16035 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMP2P16035 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms