Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRAFP15056 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRAFP15056 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRAFP15056 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRAFP15056 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRAFP15056 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRAFP15056 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRAFP15056 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRAFP15056 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRAFP15056 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRAFP15056 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRAFP15056 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRAFP15056 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRAFP15056 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRAFP15056 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRAFP15056 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRAFP15056 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRAFP15056 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRAFP15056 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRAFP15056 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRAFP15056 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRAFP15056 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRAFP15056 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRAFP15056 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRAFP15056 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRAFP15056 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRAFP15056 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRAFP15056 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRAFP15056 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRAFP15056 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRAFP15056 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRAFP15056 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRAFP15056 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRAFP15056 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRAFP15056 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRAFP15056 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRAFP15056 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRAFP15056 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRAFP15056 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRAFP15056 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRAFP15056 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRAFP15056 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRAFP15056 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRAFP15056 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRAFP15056 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRAFP15056 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRAFP15056 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRAFP15056 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BRAFP15056 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BRAFP15056 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRAFP15056 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRAFP15056 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRAFP15056 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRAFP15056 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRAFP15056 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRAFP15056 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRAFP15056 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRAFP15056 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRAFP15056 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRAFP15056 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRAFP15056 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRAFP15056 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRAFP15056 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BRAFP15056 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRAFP15056 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRAFP15056 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRAFP15056 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRAFP15056 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRAFP15056 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRAFP15056 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
BRAFP15056 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BRAFP15056 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRAFP15056 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRAFP15056 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRAFP15056 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRAFP15056 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRAFP15056 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRAFP15056 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BRAFP15056 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRAFP15056 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRAFP15056 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRAFP15056 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRAFP15056 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRAFP15056 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRAFP15056 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRAFP15056 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRAFP15056 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRAFP15056 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRAFP15056 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRAFP15056 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRAFP15056 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms