Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB2P14652 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXB2P14652 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms