Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT5P13647 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT5P13647 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT5P13647 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT5P13647 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT5P13647 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT5P13647 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT5P13647 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT5P13647 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT5P13647 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT5P13647 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT5P13647 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT5P13647 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT5P13647 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT5P13647 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT5P13647 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT5P13647 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT5P13647 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT5P13647 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT5P13647 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT5P13647 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT5P13647 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT5P13647 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT5P13647 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KRT5P13647 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT5P13647 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT5P13647 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT5P13647 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT5P13647 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KRT5P13647 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT5P13647 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT5P13647 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT5P13647 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT5P13647 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT5P13647 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT5P13647 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT5P13647 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT5P13647 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT5P13647 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT5P13647 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT5P13647 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT5P13647 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT5P13647 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT5P13647 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT5P13647 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT5P13647 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT5P13647 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT5P13647 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT5P13647 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT5P13647 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT5P13647 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT5P13647 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT5P13647 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT5P13647 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT5P13647 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT5P13647 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT5P13647 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT5P13647 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT5P13647 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT5P13647 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT5P13647 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT5P13647 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT5P13647 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT5P13647 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT5P13647 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT5P13647 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT5P13647 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT5P13647 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT5P13647 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT5P13647 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT5P13647 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT5P13647 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT5P13647 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT5P13647 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT5P13647 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT5P13647 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT5P13647 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT5P13647 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT5P13647 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT5P13647 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT5P13647 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT5P13647 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT5P13647 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT5P13647 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT5P13647 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT5P13647 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT5P13647 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT5P13647 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms