Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ITGA4P13612 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITGA4P13612 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITGA4P13612 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms