Protein–RNA interactions for Protein: P13591

NCAM1, Neural cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM1P13591 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NCAM1P13591 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NCAM1P13591 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NCAM1P13591 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms