Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT3P12035 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT3P12035 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT3P12035 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT3P12035 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT3P12035 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT3P12035 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT3P12035 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT3P12035 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT3P12035 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT3P12035 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT3P12035 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT3P12035 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT3P12035 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT3P12035 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT3P12035 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT3P12035 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT3P12035 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT3P12035 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT3P12035 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT3P12035 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT3P12035 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT3P12035 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT3P12035 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT3P12035 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT3P12035 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT3P12035 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT3P12035 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT3P12035 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT3P12035 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT3P12035 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT3P12035 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT3P12035 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT3P12035 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT3P12035 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT3P12035 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT3P12035 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT3P12035 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KRT3P12035 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT3P12035 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT3P12035 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT3P12035 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRT3P12035 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT3P12035 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT3P12035 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT3P12035 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT3P12035 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT3P12035 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT3P12035 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT3P12035 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT3P12035 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT3P12035 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRT3P12035 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT3P12035 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT3P12035 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT3P12035 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT3P12035 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT3P12035 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT3P12035 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT3P12035 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT3P12035 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT3P12035 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT3P12035 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRT3P12035 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT3P12035 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT3P12035 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT3P12035 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT3P12035 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT3P12035 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRT3P12035 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT3P12035 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT3P12035 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT3P12035 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT3P12035 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KRT3P12035 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms