Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
LAMC1P11047 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LAMC1P11047 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LAMC1P11047 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms