Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP3P10745 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP3P10745 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP3P10745 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP3P10745 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP3P10745 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBP3P10745 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP3P10745 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP3P10745 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP3P10745 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP3P10745 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP3P10745 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP3P10745 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP3P10745 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP3P10745 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP3P10745 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBP3P10745 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBP3P10745 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP3P10745 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP3P10745 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP3P10745 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP3P10745 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP3P10745 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP3P10745 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP3P10745 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP3P10745 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP3P10745 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBP3P10745 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP3P10745 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBP3P10745 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP3P10745 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP3P10745 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP3P10745 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP3P10745 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP3P10745 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP3P10745 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBP3P10745 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBP3P10745 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBP3P10745 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBP3P10745 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP3P10745 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP3P10745 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP3P10745 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP3P10745 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP3P10745 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBP3P10745 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP3P10745 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP3P10745 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP3P10745 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP3P10745 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP3P10745 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP3P10745 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP3P10745 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP3P10745 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBP3P10745 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBP3P10745 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP3P10745 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP3P10745 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP3P10745 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP3P10745 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP3P10745 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP3P10745 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP3P10745 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBP3P10745 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP3P10745 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP3P10745 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP3P10745 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP3P10745 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP3P10745 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBP3P10745 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP3P10745 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP3P10745 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBP3P10745 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms