Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPP1P10451 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPP1P10451 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPP1P10451 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPP1P10451 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPP1P10451 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPP1P10451 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPP1P10451 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPP1P10451 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPP1P10451 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPP1P10451 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPP1P10451 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPP1P10451 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPP1P10451 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPP1P10451 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPP1P10451 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SPP1P10451 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPP1P10451 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPP1P10451 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPP1P10451 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPP1P10451 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPP1P10451 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPP1P10451 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPP1P10451 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPP1P10451 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPP1P10451 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPP1P10451 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPP1P10451 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPP1P10451 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPP1P10451 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPP1P10451 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPP1P10451 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPP1P10451 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPP1P10451 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPP1P10451 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPP1P10451 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms