Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RD3LP0DJH9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RD3LP0DJH9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms